Wyróżnienia i nagrody za działalność dydaktyczną i naukową:
- Już w 2000 roku (po jedynie siedmiu latach działalności) zespół Zakładu Immunologii otrzymał nagrodę dydaktyczną I stopnia JM Rektora AM w Warszawie "Za wybitnie osiągnięcia dydaktyczne".
- Pracownicy naszego zakładu byli trzykrotnie nagradzani przez Fundację im. Tomasza Jakuba Michalskiego za wybitne osiągnięcia w badaniach nad nowotworami (w 2003 roku – Jakub Gołab, w 2008 roku – Tomasz Stokłosa i w 2011 roku - Dominika Nowis).
- Nasi profesorowie dwukrotnie otrzymali subsydia profesorskie MISTRZ przyznawane przez Fundację na Rzecz Nauki Polskiej. W 2000 roku takie wyróżnienie stało się udziałem profesora Marka Jakóbisiaka, w 2008 roku – profesora Jakuba Gołąba. Ważnym kryterium przyznawania tego subsydium było promowanie i efektywne wciąganie do pracy naukowej młodych naukowców.
- W 2000 roku Marek Jakóbisiak otrzymał Medal Polskiego Towarzystwa Immunologicznego im. Ludwika Hirszfelda, w 2001 roku - Medal Komisji Edukacji Narodowej, zaś w 2005 roku został uhonorowany Nagrodą Prezesa Rady Ministrów za wybitny dorobek naukowy.
- W 2002 roku Jakub Gołąb otrzymał Nagrodę Wydziału Medycznego Polskiej Akademii Nauk za cykl prac dotyczących terapii fotodynamicznej nowotworów, w 2006 roku - Nagrodę im. Tadeusza Borowicza Polskiej Akademii Umiejętności oraz Nagrodę im. profesora Stefana Pieńkowskiego za znaczące osiągnięcia naukowe w dziedzinie eksperymentalnej fizyki, astronomii, chemii i biologii. Ponadto Jakub Gołąb został laureatem programu TEAM Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej w 2008 roku. W 2012 roku nasi badacze zostali nagrodzeni przez Prezesa Rady Ministrów RP - Jakub Gołąb za wybitny dorobek naukowy, a Dominika Nowis za rozprawę habilitacyjną.
- Nasi pracownicy trzykrotnie byli nagradzani przez tygodnik POLITYKA Stypendium „Zostańcie z nami” – w 2002 roku wyróżnienie to otrzymał Jakub Gołąb, w 2008 roku – Dominika Nowis, zaś w 2012 roku - Magdalena Winiarska.
Trzykrotnie również nasz zakład został nagrodzony trzyletnim stypendium Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla Wybitnych Młodych Naukowców (w 2006 roku laureatem tego wyróżnienia był Jakub Gołąb, w 2008 roku – Dominika Nowis a w 2012 roku - Magdalena Winiarska). - Doktor Tomasz Stokłosa w latach 2000-2003 był laureatem prestiżowego stypendium National Cancer Institute (NCI) przyznanego na realizację badań naukowych w Temple University w Filadelfii.
- Doktorantkom z naszego Zakładu czterokrotnie zostało przyznane stypendium L'Oreal dla Kobiet i Nauki (w 2003 - Dominice Nowis, w 2004 - Katarzynie Kozar-Kamińskiej, w 2007 roku – Magdalenie Winiarskiej a w 2012 roku - Angelice Muchowicz).
- Nasi studenci trzykrotnie otrzymali Laur Medyczny im. Doktora Wacława Mayzla przyznawany przez Wydział Nauk Medycznych Polskiej Akademii Nauk wyróżniającym się studentom (w 2004 roku - Marcin Makowski, Paweł Mróz i Piotr Mrówka, w 2006 roku - Tadeusz Issat, w 2009 roku - Marek Bugajski i Paweł Salwa).
- Nasi studenci i młodzi pracownicy jedenastokrotnie otrzymali stypendia wyjazdowe UICC (International Union Against Cancer) na realizację projektów naukowych z dziedziny eksperymentalnej onkologii.
- W 2012 roku dwie studentki z naszego Zakładu (Małgorzata Wańczyk i Magdalena Gabrysiak) otrzymały Diamentowe Granty przyznawane przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego. Małgorzata Wańczyk w 2011 roku została również wyróżniona w konkursie ELLE - Dziewczyny Przyszłości.